ARC Centre of Excellence for Plant Energy Biology

MPIC — TOM20 Interactive MatGAT

Percentage protein sequence similarity and identity scores were generated using MatGAT (Campanella et al., 2003).

Top right = % identity,
Bottom left = % similarity.

1. Point at a cell to temporarily highlight the primary green and secondary light green comparison genes.
2. Click to keep cyan highlighting (click again to remove the highlighting).

123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
1. gi|302850820|hypotheticalproteinVOLCADRAFT_107457Vc|ref|XP_002956936.1 1217171719151617181517151818182716161513171810171717141615151616151821171616121314121317151717
2. CBJ27905.1EsMTSRLAAWQCGLVFLVACFPRQASSFLFCPTVPSAASRPARTSTTTAAAPEGDASAQEGTTATPPPSLDR|emb|gi|298715256 2118151918181916211819141614161515161418171615161918181610121417151714181516151916181414141918
3. 29929.t000160-Rc 2836654348545458545155445954623563635946485019675158282615146249424937666366171616171733505754
4. 30190.t000164-Rc 2738825050525360606363487462783774675852555620805660282717167257475640697868201717161534626255
5. 437971-Sm 2935636455394248444643344641473551443938454615514642202314114642355543454643171714141528423945
6. 74372-Sm 2837717372414147464745374845484348484436494919525044242314144742355943484647201816181529444346
7. Bra010946 Species Brassica rapa 2735717362666672464243374947513349544837434515544049242614144739364333545052162317171526404164
8. Bra030044 Species Brassica rapa 2834716959638378444447385652543454554840444418554151252414135342354434575454151817171428394366
9. Bra032826 Species Brassica rapa 3035757462678588514853396056603761595143484721624553282415165845415037645860191615181429444776
10. Bra032980 Species Brassica rapa 2737717562706664685469495947563958534842504720594749232415145743385238535152171413121836546449
11. Carubv10005798 Species Capsella rubella 2737738263716563677555485548563558535239474621604850262514135347405138525753191311171537665548
12. Carubv10018043 Species Capsella rubella 2737737860696867718079566150563759555140474721604552242514146047415338585854181815161443538249
13. Carubv10018077 Species Capsella rubella 2736646657616057616770744642483144434330424119494044242415124542394231464447181819151451475638
14. Cucsa.054120.1 Species Cucumis sativus 2737788764747271767678806756723973615349525322755653272616147354455439676563151917151434545956
15. Cucsa.395030.1 Species Cucumis sativus 3033707059646866716262655770623360615443464618644353312717166048404837645761171517171631454949
16. Eucgr.I01647 Species Eucalyptus grandis 2936768666697270757275756683723876655754535520825256292816167152475638676666181717161634575852
17. g13148.t1 3434565957625556575859585260535938343126383919383834202312123935304233393438122114181726343535
18. Glyma05g14300.1 Species Glycine max 2636808468727471767375756383728359675868535418805457302818167254486042676565181713171534555754
19. Glyma11g37120.1 Species Glycine max 2836818266747369727274746479708258808550515219725168312415156352455338685965161717181434515356
20. Glyma18g01030.2 Species Glycine max 2632737460686563656773676471637352728942444520634461282714135549404532615261181815171533484948
21. Glyma19g17930 Species Glycine max 2036566150555252535455544961506143696056383927584042241812125241364430484546181715161325354039
22. GRMZM2G100402 Species Zea mays 2837717166696466666467695875637061726860528824577551222514145248425540475345181620141527454451
23. GRMZM2G105531_T01 Species Zea mays 2739727466706768666167706074637460737163539226587651232514135346435540495347172118131628474550
24. GRMZM2G314434_T01 Species Zea mays 16273028283126282731302934292626302925324133352221201217882019201914171818161016131215222117
25. GSVIVG01033094001 Species Vitis vinifera 2937829169767571767782796790738959878675667578316062302617157959516141746972171818151635575956
26. LOC_Os01g69250 Species Oryza sativa 2838717668736364656569685977627458747062558787327949232315135547415541495247192017151629484548
27. Medtr3g085410 Species Medicago truncatula 2836757660696867686872726170657455738275536871307769322513155649434736605758191716161630464953
28. Medtr3g085420 Species Medicago truncatula 2630444238404140423941413941474336444542333839204235481915172823222220302830151616151621242324
29. Medtr6g012540 Species Medicago truncatula 2734454643404344424542444246444843464343304342264143433914142724242621252624161714161916252322
30. Medtr6g044560 Species Medicago truncatula 2617222221212221212221222122252219242119182121112322202424201614121413151514121111101313121513
31. Medtr7g099160 Species Medicago truncatula 2420222222212322242222222022272321232320172221132422222624381413121514131514121213101515141414
32. PGSC0003DMG400020255 Species Solanum tuberosum 2737798565717371747477786585738461827868617374318774754343212258495839716866181614181535545954
33. PGSC0003DMG401022140 Species Solanum tuberosum 2539687263656161646269636273606856696865566564277267654041201975684532535453151714161633434344
34. PGSC0003DMG402022140 Species Solanum tuberosum 2332606453545453575561565763516249626157555860336559563338181864754230444542191717171429413839
35. Phpat.016G052500 Species Physcomitrella patens 2938717675806664687072726275677761777565557577327976673946212378666165525149162016181632485246
36. Phpat.027G024400 Species Physcomitrella patens 3629545757605052535253524756575649585548415557235757504142242457494471383835171717181830343734
37. Potri.001G054900 Species Populus trichocarpa 2837838265747371767475766781738059778274576971308571754545212381706174556587161514151633525561
38. Potri.001G330200 Species Populus trichocarpa 3036828965687371747278786583688158807669587275318573724342212483696173558062191814151534545454
39. Potri.003G173400 Species Populus trichocarpa 2735838165727168757375766982727756788274566871338471764341212379695975549377171415131332515455
40. YGR082W-Sc Species Saccharomyces cerevisiae 2132363238363332323538353932283430323435323735273439372833192032323432323532353323261317201917
41. gi|85104848-Nc 2239333432343533333335343435323636343134312934223633342830181933353332283631365522271417192016
42. gi|17560096-Ce 2033332934333231323029333437313031323234313635253235333126161831373535313134364444281612171917
43. gi|46409384-Hs 2033302829353030282728283228282928283234323131272832302629171629313627293129264247511313161617
44. XP_642798-Dd 2829312929273029293032312626303228292927212731193327293535272831262530352929272826282218151518
45. AT3G27070 Species Arabidopsis thaliana 2633474943464643475050546449515043495044374345234845464136232450433948484849473232282733344328
46. AT5G40930 Species Arabidopsis thaliana 2638677459646057617379706874597256686868526264297366643840192270666167497074703935352628465447
47. AT3G27080 Species Arabidopsis thaliana 2636717758666463677978907480647458747264536767297868694042222277615570517575753632362730557046
48. AT1G27390 Species Arabidopsis thaliana 3037727259668078826566705973667059767164516566267566673941212371635668527271703232302730466168

Sequences (FASTA)