MPIC - TIM9 Interactive MatGAT

MPIC — TIM9 Interactive MatGAT

Percentage protein sequence similarity and identity scores were generated using MatGAT (Campanella et al., 2003).

Top right = % identity,
Bottom left = % similarity.

1. Point at a cell to temporarily highlight the primary green and secondary light green comparison genes.
2. Click to keep cyan highlighting (click again to remove the highlighting).

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31
1. XP_644845.1Dd		23	23	22	22	23	22	21	27	21	21	23	23	26	28	27	26	22	25	24	25	26	18	22	27	22	21	22	29	24	23
2. 29977.t000006Rc	48		58	71	69	73	74	42	77	63	59	75	75	75	76	75	74	54	76	62	65	75	34	75	43	28	27	29	30	31	36
3. 74249Sm	54	73		66	67	61	65	38	62	54	51	62	62	66	65	62	66	44	63	67	70	61	29	65	38	33	32	32	27	38	37
4. Bra027011Br	50	85	75		90	87	95	40	77	59	60	76	76	75	74	75	75	52	77	63	68	73	33	96	43	33	29	31	31	35	38
5. Bra039260Br	50	83	77	96		84	88	39	75	56	56	73	73	74	69	70	74	46	71	63	68	72	32	89	40	34	30	32	31	35	34
6. Carubv10014995Cru	46	88	73	96	94		93	42	76	59	60	75	75	72	74	75	71	54	73	66	69	77	34	91	43	31	28	32	29	36	38
7. Carubv10019530Cru	48	88	75	98	96	98		42	81	60	60	80	80	77	77	79	76	53	77	69	71	76	36	99	42	31	28	33	31	35	38
8. Cre01.g033400Cre	42	65	54	58	57	61	60		42	38	36	41	41	43	42	41	43	33	41	42	45	40	56	42	37	32	31	29	31	41	31
9. Cucsa.175450Cs	51	85	76	87	85	89	89	64		65	68	85	85	86	84	85	85	56	81	68	73	73	38	82	41	30	28	30	30	32	38
10. Eucgr.A01265Eg	47	76	67	77	75	75	77	63	77		56	63	63	66	70	70	67	57	65	55	56	59	30	61	38	27	24	28	25	31	37
11. Glyma03g19460Gm	50	83	70	84	83	86	86	64	90	81		67	67	66	68	67	66	65	65	61	61	55	36	61	33	27	24	27	25	30	33
12. Glyma11g14830Gm	51	82	75	84	83	87	86	59	90	75	88		99	85	88	87	84	55	84	67	72	73	37	81	41	31	29	29	28	34	37
13. Glyma12g06770Gm	51	82	75	84	83	87	86	59	89	75	88	100		85	87	87	84	56	84	67	72	74	37	81	41	32	30	29	28	34	38
14. GRMZM2G144101Zm	53	84	77	84	83	87	87	60	94	80	86	89	88		89	89	98	55	86	68	73	74	40	79	40	31	28	29	29	34	40
15. GSVIVG01024961001Vv	53	87	77	83	82	85	85	61	94	80	87	93	93	97		94	88	58	86	73	77	75	39	79	40	30	28	30	26	36	40
16. GSVIVG01034172001Vv	51	84	74	84	83	86	86	61	91	79	87	90	89	95	96		88	57	87	69	74	74	39	80	41	30	28	28	28	36	40
17. LOC_Os12g38310	53	84	79	85	84	87	87	60	94	80	86	89	88	99	97	95		56	86	67	73	73	40	77	41	32	29	29	29	34	40
18. Medtr4g021710	50	74	62	70	69	72	71	53	76	75	81	77	77	76	80	78	76		57	51	53	53	32	53	34	25	25	29	24	29	36
19. PGSC0003DMG400019201	51	85	76	85	84	85	87	59	93	79	86	91	90	95	96	94	96	75		69	73	73	39	79	42	30	28	28	32	37	38
20. Phpat.020G026400	50	76	81	81	82	81	83	58	84	70	79	83	83	84	85	82	84	68	86		90	64	39	68	33	30	26	30	27	34	35
21. Phpat.024G058800	54	78	82	80	81	82	82	58	88	72	83	87	87	86	88	86	87	71	87	93		67	42	70	37	32	30	31	28	37	37
22. Potri.012G039100	51	89	75	87	86	86	86	56	86	76	85	84	84	86	85	84	86	77	84	76	77		33	76	40	30	30	28	31	36	39
23. Vocar20008734	42	53	45	52	53	55	55	62	59	52	52	54	54	57	56	57	57	44	55	56	54	51		36	26	23	19	18	25	28	25
24. AT3G46560	48	88	75	98	96	98	100	60	89	77	86	86	86	87	85	86	87	72	87	83	82	87	55		42	31	28	33	31	36	38
25. YEL020W-ASc	51	62	61	67	63	66	66	55	65	57	63	62	61	61	61	61	61	57	61	59	61	60	49	66		34	30	39	40	39	36
26. gi\|71982227Ce	41	43	48	45	45	48	44	45	46	46	47	45	45	43	44	44	44	43	45	47	49	46	44	44	54		86	39	28	34	28
27. gi\|17538524Ce	40	45	50	45	45	48	44	47	47	47	46	48	48	44	45	46	45	46	46	46	50	52	36	44	53	87		36	25	30	28
28. gi\|6912714\|NP_036592Hs\|ref	45	50	51	50	51	54	52	49	50	50	48	50	50	50	50	47	50	45	48	50	51	48	39	52	55	60	61		32	33	25
29. gi\|85080688Nc	46	50	48	52	51	52	52	51	56	45	51	51	50	48	47	47	48	45	52	50	50	51	48	52	66	52	53	51		30	26
30. Esi0075_0052Es	46	51	53	51	54	52	48	53	55	56	53	52	53	56	57	53	56	47	54	56	59	53	42	52	61	50	51	56	52		32
31. CMR213CCm	42	54	52	57	55	56	56	55	55	53	55	55	55	56	56	54	56	55	55	52	55	59	38	56	55	42	46	41	43	48

Sequences (FASTA)