MPIC - TIM22 Interactive MatGAT

MPIC — TIM22 Interactive MatGAT

Percentage protein sequence similarity and identity scores were generated using MatGAT (Campanella et al., 2003).

Top right = % identity,
Bottom left = % similarity.

1. Point at a cell to temporarily highlight the primary green and secondary light green comparison genes.
2. Click to keep cyan highlighting (click again to remove the highlighting).

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30
1. 230551		49	60	62	58	41	48	60	61	61	59	37	59	60	59	59	56	62	48	56	39	29	27	32	32	31	32	33	56	56
2. 30209.m001533\|30209.t000032	69		60	60	58	34	45	61	60	61	49	37	61	49	58	58	60	45	65	64	30	25	25	24	24	23	29	24	59	59
3. Bra016560	78	78		88	81	41	52	68	68	68	67	44	74	68	65	65	73	54	61	73	38	28	31	32	31	28	34	29	82	82
4. Bra031026	78	75	95		86	40	53	68	67	68	68	45	75	69	65	65	74	61	64	75	39	31	31	31	31	30	34	31	86	86
5. Carubv10010466	77	74	91	92		40	56	70	66	67	67	42	73	65	66	66	72	58	62	74	38	29	30	32	32	26	33	29	94	94
6. Cre01.g021050	56	48	52	53	56		34	41	39	38	41	26	41	40	42	42	41	39	34	41	68	30	28	26	30	32	31	31	41	41
7. Cucsa.151920	64	59	66	64	67	51		55	58	59	53	31	60	52	57	57	56	43	47	57	36	26	30	28	29	27	28	28	55	55
8. Eucgr.K02762	81	78	84	82	84	55	69		75	75	64	41	79	65	76	76	74	60	65	73	35	28	30	29	31	28	31	30	70	70
9. Glyma09g35780	81	76	85	83	83	54	68	89		99	67	43	80	71	84	84	77	58	62	71	39	33	28	30	33	28	34	35	65	65
10. Glyma12g01980	81	76	85	83	83	54	68	89	100		67	43	81	71	85	85	77	59	63	72	38	33	28	30	33	28	33	35	66	66
11. GRMZM2G007080	78	72	79	82	81	53	66	80	80	79		58	72	85	64	64	72	57	55	66	42	33	27	28	30	31	31	31	67	67
12. GRMZM2G357152	49	50	53	54	54	36	41	53	53	52	59		48	55	39	39	47	38	41	42	26	22	19	24	23	21	25	26	42	42
13. GSVIVG01024670001	79	77	86	88	87	54	70	90	87	88	82	56		74	77	77	80	57	66	76	38	31	29	30	29	28	31	31	73	73
14. LOC_Os03g18500	81	72	86	87	84	53	65	82	85	84	89	59	85		65	65	72	57	54	65	40	33	26	32	31	30	35	33	66	66
15. Medtr4g077950	79	75	82	83	81	54	66	85	92	93	77	51	87	81		100	75	55	60	69	39	32	30	32	29	28	34	33	66	66
16. Medtr4g078050.1	79	75	82	83	81	54	66	85	92	93	77	51	87	81	100		75	55	60	69	39	32	30	32	29	28	34	33	66	66
17. PGSC0003DMG402019636	76	78	84	83	83	53	67	86	89	89	84	56	88	86	90	90		55	62	72	38	31	30	29	28	28	31	31	71	71
18. Phpat.012G063000	79	65	73	76	73	52	58	75	75	75	74	52	76	75	71	71	72		44	54	39	33	27	30	32	27	30	30	56	56
19. Potri.001G281200	69	79	76	78	76	46	61	79	77	77	72	52	79	74	76	76	78	67		81	35	25	25	27	26	22	28	28	62	62
20. Potri.009G076400	77	78	82	83	82	53	70	83	85	85	79	51	83	79	82	82	82	71	85		41	29	28	29	32	27	32	32	74	74
21. Vocar20010161	56	48	52	54	53	83	51	55	53	53	55	36	55	53	55	55	53	51	49	56		31	30	30	30	31	32	28	39	39
22. YDL217CSc	42	42	42	44	45	43	47	45	49	50	45	31	47	47	49	49	47	44	39	45	47		24	26	29	42	26	29	28	28
23. gi\|17532463Ce	45	40	45	45	45	44	50	44	43	45	44	30	43	40	44	44	45	40	39	44	49	44		31	37	28	24	28	29	29
24. gi\|66810255Dd	50	49	50	51	50	43	45	52	51	50	46	40	49	50	51	51	50	45	45	49	50	42	45		28	25	26	29	31	31
25. gi\|56606061Hs	50	44	47	45	49	52	47	49	47	47	49	35	47	49	50	50	49	49	41	49	56	48	53	48		33	34	32	32	32
26. gi\|164426913Ncrassa	44	39	41	41	41	45	45	40	42	42	41	28	40	41	42	42	44	40	34	39	44	58	46	39	46		28	30	27	27
27. CMS209CT	54	53	54	51	51	48	49	53	56	56	56	41	55	56	56	56	53	50	48	54	49	45	44	51	53	43		29	35	35
28. Esi0063_0018	47	41	45	46	46	45	43	44	50	50	46	36	45	47	50	50	48	45	39	46	41	43	44	44	45	41	49		29	29
29. AT3G10110	77	75	91	93	96	56	67	84	82	83	82	53	87	84	81	81	84	71	76	82	55	45	45	49	49	41	51	45		100
30. AT1g18320	77	75	91	93	96	56	67	84	82	83	82	53	87	84	81	81	84	71	76	82	55	45	45	49	49	41	51	45	100

Sequences (FASTA)