ARC Centre of Excellence for Plant Energy Biology

MPIC — TIM21,TIM21-LIKE-1,TIM21-LIKE-2 Interactive MatGAT

Percentage protein sequence similarity and identity scores were generated using MatGAT (Campanella et al., 2003).

Top right = % identity,
Bottom left = % similarity.

1. Point at a cell to temporarily highlight the primary green and secondary light green comparison genes.
2. Click to keep cyan highlighting (click again to remove the highlighting).

12345678910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455
1. Mtr.10944.1.S1_atmedicagotim21-like Species Medicago truncatula 10151616141718232615172718151517261825141918223213162815142339249303216121824152315162415251617151917192811
2. Tim21medicagocontig_129437:1..1349 Species Medicago truncatula 18891389197823891688881989151879171071613812847811182271881597198236127161676
3. gi|156142176Hs Species Homo sapiens 291521272022261919181819221818181822201722271719102018211918181912171617102516251621141725192316201722232014
4. YGR033C Species Saccharomyces cerevisiae 331646211827191616171618161514161723181918201618111819181518161713191916102218191617191619171816151618171713
5. gi|351063723Ce Species Caenorhabditis elegans 33204643222421141520151721171715152314141921131512201620181417159141317122514231519171420172416181519191515
6. Esi_0103_0070 Species Ectocarpus siliculosus 311736324420191416211616181817171620161618191415131614151613141611151517132215181315141520141814161416151512
7. gi|85105583|ref|XP_961997.1Nc Species Neurospora crassa 271347484236211618202017201819211725161620211619142216201918211813181919112419231821191822152414191420211716
8. AT4G00026 Species Arabidopsis thaliana 282048424531421818421717521717171773161569861921123119544419171913171823145318541853161753195716471655541818
9. AT3G56430 Species Arabidopsis thaliana 3093028242227307412355617242435681770171917915520185717175421552653541371451155116405216541244164416175817
10. AT2G40800 Species Arabidopsis thaliana 361334322724313681114266182727428617791818187272241866171758236023626314101552145116475117621444164417166615
11. 111521 282734323939355119231712341414171145131538411214172614372913151410141426194612431238201544135711351137361313
12. 112658 321335373229384049562944193737994318431518193532161841161939204019464516101743184317454320431643184217174317
13. 29729.m002393|29729.t000126 Species Ricinus communis 351232313025323569812360202930436519631817175646221770171862266323636314101857185618505618621643164419187516
14. 30174.m008783|30174.t000180 Species Ricinus communis 281837353730376730334335361616201652161652511520112818534718191813191820124920482060161947175117451868701822
15. 65001 291636393335363336423456463199362918291618182320141627171826182815303016111729192917383117271726162420182713
16. 65904 2916363833323733364233574631100362918291818182320141628171826182915313116111730192916393117281727162420182714
17. 78719 3213363732303640495629100593656574319421318183532161841171939194019464516101743184316454220431643174218164317
18. Bra004587 Species Brassica rapa 351233332727323377912259823444445917791918166664242066171657236223636414101755165416495315631643184217176613
19. Bra007092 Species Brassica rapa 312247434634498228335635336538383633181678691619132917524117181713171624155519531949181752205817451852511718
20. Bra007246 Species Brassica rapa 341235322724333177892358803343435889321818166957221860171656225823616213101655145516485416611744174519186514
21. Bra016969 Species Brassica rapa 331735333630332824253331262638383026312716161817251515131215161611151913131517171714261918171316141514151711
22. Bra037306 Species Brassica rapa 281841373729407833354738347032323833823532691920112818534418181714181822135118491851191849195317431655541719
23. Carubv10001670m.g Species Capsella rubella 291945414230439031364937346833333834773130781819103017534318161812161723145317531752171754175516481753551818
24. Carubv10017250m.g Species Capsella rubella 3092928232030319580194867293535487628772432305319175616175322532652531371550155015395315531244174416165716
25. Carubv10023715m.g Species Capsella rubella 441435332929324162752654633638395473356930404260102347171940274217444416101937193617273721431632153118194813
26. Carubv10024489m.g Species Capsella rubella 22281922232220182125322225172424222522243419182117122211101914207232416161119121993819112115159141111228
27. Cre09.g405550.t1.2 Species Chlamydomonas reinhardtii 301542393934435330343934324734343434523129465129402117272618171814181918112818311729151830173217321732331533
28. Cucsa.237950.1 Species Cucumis sativus 36103333292431327182235580344242557931782733316961243318186026622463651591754165318475417601541164317176717
29. Cucsa.364430.1 Species Cucumis sativus 271838343827366833364531356631303138643625686730371747354917161814141920124718501960191950185017441856531720
30. Eucgr.D01510.1 Species Eucalyptus grandis 241431293227325638403532375930303238543623585535361540386318151717191918104018411748161739184118391847481821
31. Eucgr.G03152.1 Species Eucalyptus grandis 31113032262530317275215375314040537129712431336956223073303348862757571371753185217444917541542184419196015
32. Eucgr.G03162.1 Species Eucalyptus grandis 571731343628343431333032343130313132333332293431422430342926484211222217111823172216172120211717161717162612
33. Eucgr.L02349.1 Species Eucalyptus grandis 34113132272632326878225680334344567728752533356757243376343388462561601381753185416475217571542174318196115
34. g5121.t1 166202117162121413715313723232331362036172322402812223825284118382322961226122715172614231127152813152516
35. Glyma04g40191.1 Species Glycine max 39113236292632326677246278344747627833762937336464253475343268357536941492056195514515420581741184218186516
36. Glyma06g14620.1 Species Glycine max 40113436282632326677246276344748627931763036326564263777363769357637961591955185518525518601642184318176617
37. Glyma06g38190.1 Species Glycine max 281932333937323421244131263230303125382536343521292933223328213023152627212813241222181222152611211320241512
38. Glyma08g37602.1 Species Glycine max 192818181923171911142916151618181613211418171811163019131513121714913152518914812129148198118131397
39. Glyma10g31810.2 Species Glycine max 312443425037436724285734326036343429692730656525352146285847273728193030382318531847141652185915371551481817
40. GRMZM2G061187_T01 Species Zea mays 321131332625313066732156723342435671327226303065552129703334683170396971231327189218447817561445184720205616
41. GRMZM2G174236_T01 Species Zea mays 292043404635457128315234336035353432693032646627372151326051303433203234342065301951171775155317451748501619
42. GRMZM2G459861_T01 Species Zea mays 301130312522303066722156723342425670317226313165532130703636683070416869231327953018437917531445174618195515
43. GSVIVG01022807001|GSVIVT01022807001 Species Vitis vinifera 261837343728396631344533357331303336623328686729381748367159333032243236341558346236171651185317471661631620
44. GSVIVG01032862001|GSVIVT01032862001 Species Vitis vinifera 311430384135343247543660563060616057345544333146414230543328503055265960341830492949324317481734153518174913
45. LOC_Os01g07382.1 Species Oryza sativa 331132312624303066712256713342435670297128312865512231723233683070377071231328873289334916551447184817185315
46. LOC_Os03g14890.1 Species Oryza sativa 292243374335417129325236356133333632713132657029391854336249303329233434332067308529633132155614451848511719
47. PGSC0003DMG400005253|PGSC0003DMT400013467 Species Solanum tuberosum 341131323024313168772258773444445878347525323266582432753739703177387272271329733172365571311544154418186116
48. PGSC0003DMG401012327|PGSC0003DMT400032113 Species Solanum tuberosum 322541395139436924296734285736363528742733636724332649265847273528192929432472256225573726632915431453521616
49. Phpat.001G020700.1 Species Physcomitrella patens 25928272623283362591954603338385459315823343360451830573335602457405657221226602960314161286026187317174216
50. Phpat.002G071500.1 Species Physcomitrella patens 281538343728396032334434336231313334583625606233371750366154323035233736311551365734633232583451371845461723
51. Phpat.007G071600.1 Species Physcomitrella patens 26929272522282861602053613237375359306123313161441828593234622659425758211227622961334261316026843317164416
52. Potri.002G140700.1 Species Populus trichocarpa 281840334031406932344635357931323434673529706832381750316860333033243436321761356233753331633561316133901820
53. Potri.014G054400.1 Species Populus trichocarpa 271841334030417031344534338129293535643326717030381750326762333031253334321860336234763332673459326031931821
54. Potri.019G062200.1 Species Populus trichocarpa 351133302924333172812156873443435681307926353370612430823739763777397978251230753373345371337626603360353215
55. Vocar20013604m.g Species Volvox carteri 2082422222225313130192628362221262829292032313427124131343830222730262821927302829342228293026343531343429

Sequences (FASTA)