ARC Centre of Excellence for Plant Energy Biology

MPIC — TIM17 Interactive MatGAT

Percentage protein sequence similarity and identity scores were generated using MatGAT (Campanella et al., 2003).

Top right = % identity,
Bottom left = % similarity.

1. Point at a cell to temporarily highlight the primary green and secondary light green comparison genes.
2. Click to keep cyan highlighting (click again to remove the highlighting).

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44
1. medicagotim17contig_66276:1037..2036		38	62	58	71	54	66	43	48	57	56	69	37	56	65	45	67	68	80	81	76	64	65	26	72	54	19	25	62	65	57	70	69	68	46	37	39	21	32	45	36	41	44	34
2. AT5G11690	50		34	36	37	33	34	64	29	35	36	37	68	32	35	25	33	35	40	40	36	37	37	20	37	36	15	17	36	34	32	35	36	34	29	36	31	19	25	35	29	39	29	23
3. AT2G37410	72	43		59	64	58	73	39	46	54	51	70	35	57	88	44	69	67	62	62	62	64	61	25	66	49	16	24	63	70	59	68	67	67	43	31	34	20	28	38	31	35	42	36
4. AT1G20350	73	47	73		66	53	60	36	59	66	59	62	35	72	59	41	61	65	61	61	59	63	61	26	62	55	19	22	61	62	51	65	63	63	41	35	36	22	29	39	32	38	43	36
5. 29912.m005433|29912.t000159	80	46	74	79		59	66	42	57	64	62	68	38	63	66	44	74	75	75	76	73	69	70	27	76	56	18	26	67	71	58	80	80	82	43	36	36	22	32	43	35	37	43	36
6. 89766	67	42	70	68	72		56	37	44	49	47	56	36	49	59	47	58	57	55	55	56	59	59	25	58	47	19	24	58	61	64	59	57	56	44	35	34	21	28	38	33	37	45	37
7. Bra005199	76	46	81	77	78	68		40	50	56	55	84	36	60	77	47	69	69	68	66	67	65	64	27	68	53	18	23	64	68	58	68	66	66	47	34	35	23	29	45	35	39	43	40
8. Bra006109	50	81	44	47	48	44	48		33	37	39	43	66	37	40	28	38	39	46	46	41	41	41	23	43	36	15	20	42	39	35	42	41	41	33	37	32	19	25	40	33	41	31	23
9. Bra016467	63	40	58	73	67	56	65	40		67	62	49	30	58	48	34	49	53	50	50	51	51	49	19	52	44	18	20	49	50	42	55	49	52	34	31	30	19	28	34	27	32	35	31
10. Bra016468	72	45	68	82	77	65	74	46	77		76	58	35	63	56	38	58	59	57	56	57	59	58	24	60	51	19	22	58	58	47	62	60	60	37	35	35	22	29	38	31	33	37	32
11. Bra016469	72	48	61	73	72	60	68	48	71	84		57	38	58	52	36	54	55	57	56	57	57	55	23	56	51	18	20	53	53	48	59	58	58	38	36	36	24	29	38	32	36	40	31
12. Bra030980	77	49	79	78	80	69	91	50	65	77	67		38	62	74	47	66	69	69	70	69	67	65	27	70	56	18	25	66	68	58	70	69	68	44	37	38	21	30	42	35	40	45	38
13. Carubv10002239m.g	50	82	44	46	49	44	46	81	40	44	48	49		34	35	27	35	35	41	41	37	38	38	20	40	34	16	19	38	35	33	38	39	37	30	39	30	20	25	36	29	41	27	23
14. Carubv10010213m.g	70	42	70	83	73	63	75	45	68	76	70	72	43		59	38	60	64	58	58	58	59	57	24	60	48	19	23	57	60	50	63	60	62	39	32	33	20	27	39	31	34	40	33
15. Carubv10023975m.g	76	45	92	74	77	74	85	47	62	71	63	83	46	74		45	69	69	66	66	65	66	64	25	69	50	17	24	65	72	59	70	68	69	45	34	32	20	27	39	33	37	42	37
16. Cre10.g452650.t1.2	55	35	57	55	58	64	57	38	47	55	49	57	36	52	58		46	45	43	43	47	44	45	21	46	37	18	20	46	46	45	46	44	45	76	32	30	17	24	36	29	34	41	41
17. Cucsa.116650.1	77	43	81	74	82	74	79	45	62	73	66	78	45	72	82	59		75	69	69	69	67	64	27	71	50	18	25	65	74	60	74	68	76	43	34	34	21	28	40	32	35	42	36
18. Cucsa.288810.1	79	47	79	78	86	75	81	47	66	76	69	79	47	76	81	59	86		68	70	68	67	65	27	73	55	18	25	66	72	59	75	71	75	43	33	39	21	28	40	34	37	44	37
19. Glyma01g01110.1	88	51	70	74	83	69	76	53	63	72	73	78	52	69	75	54	77	78		94	81	66	66	28	78	56	19	26	64	67	55	74	73	73	45	38	40	21	33	45	35	41	43	35
20. Glyma16g08520.2	87	51	70	72	82	69	72	53	62	71	72	77	52	69	75	54	76	79	97		82	67	65	28	77	55	18	26	65	68	56	72	73	73	46	39	41	22	33	45	35	41	44	36
21. Glyma20g02120.1	85	48	74	74	86	71	79	49	65	74	72	79	49	69	79	57	79	80	87	87		67	65	29	74	55	18	26	67	68	56	73	73	73	46	36	38	21	31	43	34	39	45	35
22. GRMZM2G167463_T01	76	47	71	79	79	70	77	47	66	76	70	79	47	71	75	59	77	80	75	76	78		92	41	70	62	18	28	82	68	58	69	67	68	44	38	36	22	28	43	35	39	44	38
23. GRMZM2G321404_T01	76	46	71	78	79	70	77	46	64	73	68	78	46	72	75	58	77	81	76	77	78	96		43	70	62	19	29	82	66	58	67	64	65	45	37	37	22	29	42	34	37	44	38
24. GRMZM2G437270_T01	34	33	35	37	35	32	36	40	26	36	34	35	31	35	35	27	36	36	38	38	37	46	47		27	23	19	14	34	27	25	28	28	27	20	23	17	19	14	22	18	19	20	22
25. GSVIVG01015301001|GSVIVT01015301001	81	50	73	74	85	72	79	52	63	75	70	81	53	72	77	56	79	84	86	85	85	79	79	38		58	18	27	69	73	58	75	74	73	46	40	38	21	32	44	35	40	42	34
26. LOC_Os03g30200.1	74	47	65	73	73	61	68	46	59	69	66	71	48	64	63	51	68	69	74	72	71	75	75	35	73		20	22	59	53	47	55	55	54	41	36	40	21	30	44	35	38	40	37
27. LOC_Os03g30220.1	29	21	27	28	29	29	30	21	28	30	28	29	21	30	29	28	29	28	28	28	27	31	31	23	27	29		23	19	18	17	19	19	17	18	15	16	13	14	15	23	16	18	22
28. LOC_Os05g07250.1	32	23	33	31	32	32	32	25	27	30	27	33	25	31	32	31	32	33	31	31	32	33	34	18	32	29	36		31	26	22	26	26	26	21	16	17	10	15	18	24	17	20	17
29. LOC_Os07g41330.1	74	47	75	77	78	73	81	49	62	73	66	81	48	71	78	62	78	82	74	75	78	88	87	40	81	71	30	36		68	58	70	66	69	43	35	36	21	27	42	34	36	44	39
30. PGSC0003DMG400030451|PGSC0003DMT400078245	73	44	81	75	78	78	79	45	61	71	64	78	45	73	84	59	84	84	76	75	79	76	78	36	81	65	29	32	77		62	71	70	71	44	34	35	21	28	40	34	35	42	37
31. Phpat.019G021000.1	66	42	70	66	70	78	69	43	56	64	61	66	43	66	69	56	74	74	66	66	69	69	69	34	71	61	28	33	69	74		61	60	56	43	37	33	21	30	38	31	35	46	41
32. Potri.006G165000.1	81	47	78	77	86	73	80	48	66	78	69	79	48	75	81	58	83	84	82	82	85	81	81	38	84	71	30	33	83	81	74		82	90	43	34	36	20	30	42	34	36	44	34
33. Potri.008G176500.1	82	49	75	77	88	68	77	50	64	74	70	81	51	72	78	56	80	81	83	82	85	80	79	38	85	72	28	33	81	79	70	88		82	45	36	37	23	32	42	33	36	43	36
34. Potri.018G087900.1	81	47	78	78	89	70	79	50	67	77	71	81	49	74	81	59	85	87	84	83	86	82	80	38	84	72	29	33	83	82	71	96	91		45	35	35	21	31	42	34	35	44	34
35. Vocar20010628m.g	60	41	56	60	59	59	60	44	51	58	54	60	40	54	58	79	58	58	59	60	62	59	58	27	62	58	28	29	60	58	55	60	61	62		36	34	19	29	40	32	38	41	38
36. YJL143W	51	51	41	49	50	45	45	51	45	48	50	48	49	43	45	43	45	47	53	55	50	49	49	35	52	48	22	22	47	44	47	49	50	49	48		35	19	33	45	35	69	36	31
37. gi|17539600Ce	54	44	49	51	51	50	49	48	43	51	51	51	46	45	49	41	49	53	58	59	55	51	49	32	54	56	24	25	52	50	50	50	51	51	46	55		35	31	46	39	35	35	29
38. gi|392899672Ce	33	34	29	36	33	31	35	40	27	35	32	36	34	33	33	25	30	31	33	31	33	33	31	34	32	33	21	15	33	31	31	31	34	32	28	36	44		21	24	20	21	20	21
39. gi|66806813Dd	47	34	41	44	44	43	45	39	42	44	44	48	37	40	41	37	41	40	49	49	47	42	41	30	45	45	21	23	43	42	45	44	46	45	44	48	48	36		33	27	30	30	25
40. gi|5454120Hs	56	53	47	52	53	49	52	50	42	50	52	51	52	47	49	46	50	50	58	60	56	52	51	33	55	54	24	24	53	50	50	51	51	53	53	61	61	39	53		59	47	40	34
41. gi|269784613Hs	54	41	47	52	52	50	54	40	46	51	48	55	39	47	49	45	51	54	54	53	54	54	52	28	53	51	30	33	54	50	48	53	50	53	51	49	52	29	42	67		36	34	28
42. gi|85095902Nc	52	54	44	50	49	47	48	55	45	46	51	51	54	44	47	42	45	48	55	56	52	50	50	34	53	50	23	24	49	46	48	48	48	48	48	80	54	37	44	60	49		40	33
43. CMS471CT	60	40	56	57	58	62	57	42	50	54	54	59	39	58	58	54	58	59	57	58	57	58	58	29	57	55	29	29	61	59	61	58	58	60	57	48	49	28	49	51	53	51		38
44. Esi0117_0080	48	31	53	49	47	52	53	33	44	47	44	49	31	46	50	53	53	50	49	49	50	50	49	27	47	48	35	27	53	52	52	48	49	51	49	41	43	30	38	43	46	41	54

Sequences (FASTA)