MPIC - SAM50 Interactive MatGAT

MPIC — SAM50 Interactive MatGAT

Percentage protein sequence similarity and identity scores were generated using MatGAT (Campanella et al., 2003).

Top right = % identity,
Bottom left = % similarity.

1. Point at a cell to temporarily highlight the primary green and secondary light green comparison genes.
2. Click to keep cyan highlighting (click again to remove the highlighting).

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37
1. YNL026W		25	26	20	23	21	21	22	23	21	20	21	22	21	21	21	22	20	20	20	20	19	18	15	20	20	21	19	19	20	20	23	20	20	21	20	23
2. gi\|85098006Nc	47		30	26	24	23	23	22	23	23	23	23	22	23	23	22	28	23	23	23	22	23	25	18	19	23	23	25	25	23	22	24	26	24	25	24	27
3. gi\|225543166Hs	46	48		31	25	23	27	28	25	25	26	28	25	28	27	27	28	27	28	25	25	25	25	18	22	27	27	24	24	25	26	26	27	29	27	25	30
4. gi\|17552460Ce	43	38	51		25	24	23	23	23	24	21	23	21	22	22	22	22	21	22	20	21	20	24	18	19	24	23	24	23	23	21	23	23	22	24	23	20
5. CMO061CTCm	43	43	42	41		23	24	24	23	25	24	23	24	23	24	23	26	24	24	25	26	25	25	19	18	25	23	26	26	25	22	23	25	25	24	24	26
6. Esi0503_0006Es	38	42	40	41	38		22	23	26	24	23	24	22	23	22	24	25	22	21	22	23	22	22	21	20	26	23	22	23	23	23	23	22	22	24	24	25
7. AT5G05520	38	42	43	38	44	40		77	45	62	58	75	81	71	93	77	27	60	56	55	55	53	46	32	36	58	57	44	45	55	51	62	46	46	61	60	31
8. AT3G11070	39	42	44	39	43	39	90		45	59	55	83	72	79	77	89	30	61	56	54	56	51	45	30	36	56	55	43	44	54	52	60	47	47	59	59	32
9. 139554Sm	43	42	47	45	42	45	65	65		44	45	45	43	44	44	43	29	43	44	42	41	41	40	32	30	51	46	39	39	43	38	47	51	50	44	44	31
10. 29814.t000035	40	42	42	39	44	43	82	79	63		56	60	60	58	61	58	29	63	61	60	61	58	46	33	33	59	56	46	46	60	56	62	47	49	73	72	28
11. AC197705.4_FG007	38	44	45	40	44	39	78	75	64	76		56	55	57	57	56	31	57	56	53	55	52	53	36	47	58	82	53	53	52	49	62	47	49	57	56	31
12. Bra001389	41	42	45	39	42	39	89	92	66	79	75		70	85	75	83	30	59	54	54	57	53	45	31	37	56	55	43	43	55	53	58	47	47	59	59	32
13. Bra009118	38	41	42	37	43	40	91	87	64	80	75	85		66	80	72	28	58	55	53	53	52	45	31	35	53	54	43	42	54	49	58	44	45	58	57	30
14. Bra034868	40	39	44	38	42	39	85	88	64	76	74	92	81		72	80	29	58	53	51	54	49	43	29	33	55	55	41	41	52	50	58	46	47	56	57	30
15. Carubv10000717	39	42	44	39	44	40	96	89	64	81	77	89	91	84		76	28	58	54	53	54	52	46	32	35	57	56	44	45	53	50	62	47	46	60	60	30
16. Carubv10013427	41	41	44	38	43	40	89	95	64	79	75	91	87	87	90		28	60	56	54	56	52	44	30	34	55	55	42	42	55	52	60	45	46	58	59	30
17. Cre06.g308900	40	43	44	37	44	39	48	48	45	47	48	47	48	46	48	47		30	29	30	30	30	29	21	26	29	31	28	28	30	30	31	32	32	29	28	68
18. Cucsa.137480	39	41	44	37	43	38	81	79	62	79	78	78	78	75	81	78	48		61	66	67	65	47	32	36	61	56	46	47	64	59	63	47	48	62	60	31
19. Eucgr.J00180Eg	38	43	44	39	44	39	79	78	63	79	75	77	77	74	78	77	49	78		57	59	56	48	30	34	57	55	47	47	58	51	61	47	47	60	59	29
20. Glyma02g43160	39	44	42	37	44	40	77	74	62	77	75	73	75	71	76	74	49	82	78		79	94	45	31	34	57	55	45	45	77	71	59	45	47	59	59	31
21. Glyma11g35531	38	42	41	35	41	39	77	75	62	78	75	75	75	73	77	76	49	81	77	90		77	47	31	34	59	57	47	47	79	68	61	46	47	60	60	31
22. Glyma14g06250	39	41	42	37	45	39	75	73	60	75	74	73	74	70	74	73	49	81	76	97	89		43	30	34	56	53	44	44	74	68	57	45	46	57	57	31
23. GRMZM2G057557	38	42	44	41	44	40	66	66	58	69	71	66	65	64	67	66	46	69	69	67	66	65		58	33	47	52	74	74	46	42	49	42	43	49	48	30
24. GRMZM2G062080	30	30	33	34	30	33	43	43	46	45	46	42	42	41	43	41	33	44	43	43	43	42	59		36	38	35	44	44	32	30	33	29	29	33	32	24
25. GRMZM5G832582	39	34	37	37	32	35	49	50	44	49	57	51	49	49	49	49	39	51	50	48	47	48	48	53		36	49	34	34	33	32	39	30	31	35	35	26
26. GSVIVG01032775001	40	39	48	42	42	44	74	73	72	75	73	74	71	73	73	72	46	76	72	72	72	71	66	51	52		59	46	46	57	53	65	48	48	60	60	32
27. LOC_Os05g39390	40	46	47	42	43	39	76	76	65	76	90	74	73	73	77	75	49	76	75	74	75	72	73	46	59	75		51	51	54	50	63	50	50	55	56	32
28. LOC_Os11g01490	39	45	44	41	44	39	67	66	58	68	72	66	66	64	67	66	48	69	69	68	67	66	86	52	48	65	73		99	44	41	49	42	44	48	48	29
29. LOC_Os12g01500	38	45	43	41	44	38	68	67	58	68	72	66	66	64	68	66	47	69	70	67	67	66	86	52	49	65	73	100		44	41	49	42	43	47	48	29
30. Medtr3g071450	39	42	42	37	42	39	76	75	64	79	74	75	75	73	76	74	47	78	77	86	90	85	67	44	48	74	74	68	67		67	59	45	47	59	58	30
31. Medtr5g083050	38	41	41	37	42	38	73	71	57	73	69	70	70	67	72	71	47	78	73	82	81	81	62	41	44	68	70	63	63	79		54	43	45	55	55	30
32. PGSC0003DMG400008029	41	43	44	41	44	42	82	81	65	81	81	80	79	76	82	81	47	82	81	78	79	76	71	45	53	79	81	73	73	78	75		49	49	63	63	32
33. Phpat.023G045500	38	44	45	40	43	39	70	70	70	67	67	69	69	66	69	69	48	68	68	67	66	66	64	41	44	67	69	65	65	67	62	71		82	47	46	31
34. Phpat.024G008700	42	45	46	40	45	39	70	70	69	68	68	69	69	66	69	69	49	69	70	68	66	68	67	41	45	68	69	67	67	68	62	71	89		49	48	31
35. Potri.008G071800	41	45	44	39	42	41	81	81	62	87	75	79	78	76	81	80	47	81	79	76	78	75	68	44	49	74	75	70	69	78	71	81	67	69		90	31
36. Potri.010G185600	40	44	44	40	43	41	79	79	60	86	75	78	77	75	79	79	47	79	77	76	77	74	68	44	48	73	74	68	69	76	72	79	66	67	95		30
37. Vocar20007806	41	46	47	37	43	41	51	50	47	47	49	51	49	47	51	49	81	49	48	48	49	48	48	34	38	48	50	48	47	48	46	50	51	50	49	47

Sequences (FASTA)