ARC Centre of Excellence for Plant Energy Biology

MPIC — PAM18 Interactive MatGAT

Percentage protein sequence similarity and identity scores were generated using MatGAT (Campanella et al., 2003).

Top right = % identity,
Bottom left = % similarity.

1. Point at a cell to temporarily highlight the primary green and secondary light green comparison genes.
2. Click to keep cyan highlighting (click again to remove the highlighting).

123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748
1. 29740.m000482Rc|29740.t000014 Species Ricinus communis 7162768279787675858080798371785988798078608179517348775880778367758089675680758330463846445727
2. 420475Sm Species Selaginella moellendorffii 8760697273747174747672717270725576717368557375416446725873727165787274615574757630413844475427
3. Bra005744 Species Brassica rapa 6870706272657064636259616161594463636555566362366454604761596554596361564472666326373037334327
4. Bra009555 Species Brassica rapa 8482737388808581777875777474735478788068587675466649736375768269738075695487817827453744455326
5. Bra023030 Species Brassica rapa 9090708477787274937777757970765482757772557777497248755476717763707781645575759231403742445624
6. Bra028855 Species Brassica rapa 8788789387818880807674777777755680808170618076466951756176728069727879715691828128443944435526
7. Bra034080 Species Brassica rapa 8884708789898387777674747670785679777970567572466847725971767864737978675681888128453642425525
8. Carubv10002291m.g Species Capsella rubella 8687759186969183777671777471755477788067587976446649735975738168738075725493857926444042435526
9. Carubv10015707m.g Species Capsella rubella 8385708784889390787872777870795678788069597975466747756276777966748177705684948026463844425224
10. Carubv10024357m.g Species Capsella rubella 9390708896919190888078808070785483767875558080487046775679748265728085665580809630424044415624
11. Cucsa.065620.1 Species Cucumis sativus 8888688389868687869180858072845784858771587978467646765980828771798875665780788030444046455726
12. Cucsa.308220.1 Species Cucumis sativus 8986658288848583829090788072756083798075627675486649726275737870757880665975727630454249465826
13. Eucgr.A01173.1 Species Eucalyptus grandis 8887688688888888859295887670845678868870607978457048736275828670748379695880767929434050475726
14. Eucgr.G02806.1 Species Eucalyptus grandis 9289688688888887869088898870765986788075608179497347785880748472728082685679768129484245425926
15. Eucgr.H00599.1 Species Eucalyptus grandis 8183687983857983798381798283715174747564627271436354686370657072717470705374717030473945415127
16. I3T234_MEDTRUncharacterizedproteinOS=MedicagotruncatulaPE=2SV=1|tr Species Medicago truncatula 8989688689888988879194879590825578909071588179467148746077768067728277695878797930443649465323
17. g9834.t1 7779597077747574727577807778727955585953515958395037564759545854595863598555545426423649404829
18. Glyma05g16850.1 Species Glycine max 9490698691898888869489918994848977798085618280517349796380788369778184665582788327454046425726
19. Glyma10g05710.1 Species Glycine max 8786688687888888858992869589829776899870638180467250766380808073738676715980797730443949455725
20. Glyma13g20060.1 Species Glycine max 8887698688898888869093869690839876909971648281467451786381818274758878716081807930443949455825
21. Glyma17g23760.1 Species Glycine max 8785628084808080788783858187758471928283567471446342685670677261707179595171707325393441365223
22. GRMZM2G029385_T01 Species Zea mays 7272696771727069717170717173727167747171676060366053586359565961585958605160585527413339384528
23. GRMZM2G038950_T02 Species Zea mays 9090698288898888859088868888839179918889847391477050876092758170768282725880808128473847405625
24. GRMZM2G040587_T01 Species Zea mays 8989698290888788849288858888839176908889837396466749856187807970738383695878788029464048415527
25. GSVIVG01016322001|GSVIVT01016322001 Species Vitis vinifera 5350415353515251525353545055515251555252514253514329444945444548434750453946464619302529283116
26. GSVIVG01025634001|GSVIVT01025634001 Species Vitis vinifera 7879777481777777758181758179738169797980737378784749655068707561657168584970687029403138374926
27. GSVIVG01029410001|GSVIVT01029410001 Species Vitis vinifera 5757665560585657555856565757615752595757546358573563474249454749454848513849464831332732283530
28. LOC_Os01g06454.1 Species Oryza sativa 8786678086858784848884828486818875888586807290895074565991767766717876675675757728473742405524
29. LOC_Os03g56540.3 Species Oryza sativa 7173567270737271717271717175737266757273726872715861517259595963596258624962605725443443414123
30. LOC_Os07g09450.1 Species Oryza sativa 8889688087888586838987858788838979898888827295925277599471758170768179705877767930483846405525
31. PGSC0003DMG400001767|PGSC0003DMT400004431 Species Solanum tuberosum 8884668586869087879090869185789074898888826986885180548670848468738476635575797630463648455125
32. PGSC0003DMG400017591|PGSC0003DMT400045334 Species Solanum tuberosum 9289708890899090879593899593819278919091847189895382588772889369808780675784808330483948465426
33. PGSC0003DMG400027048|PGSC0003DMT400069578 Species Solanum tuberosum 7777637777797578778080777782827975817878756980795368557977807580657170725570656627474346385027
34. Phpat.003G112600.1 Species Physcomitrella patens 8791658185848282818888858887828778888586826989875076578571888689788073625977757530423548405226
35. Potri.006G131200.1 Species Populus trichocarpa 8886688589879088869192869188849276909293816989905378568571878992798879695883808229443946415227
36. Potri.008G043500.1 Species Populus trichocarpa 9789708791899088869689899092839180948990877492925379588973918895818891696177778130433848405526
37. Potri.012G038800.1 Species Populus trichocarpa 8179667979838385838081798081818377818182737286855171588474858083838083845871696727454246445227
38. Vocar20006154m.g Species Volvox carteri 7677597076757574727576797876717894757777696780775169527767807579737976797554545730443650444728
39. AT5G03030 Species Arabidopsis thaliana 8888779388989098899287858888848874908888817189895278588671888790798488908474848126453944445526
40. AT3G09700 Species Arabidopsis thaliana 8586708685899391968987828686818872888687807187885277548571849088748187888272908226443842415324
41. AT2G35795 Species Arabidopsis thaliana 9391708895919290889990909190829176948889877192935380578873899094808892968176929030444045415624
42. YLR008C Species Saccharomyces cerevisiae 4143433539394039394041404139414247384141364441422638514136414241414239404146394041322732352730
43. Ce|gi|17509089|NP_491662.1|ref Species Caenorhabditis elegans 6156496257636261636360636263606259636060575560623955446360616364635662626560626263424050403525
44. Dd|gi|66810570|ref|XP_638992.1 Species Dictyostelium discoideum 6061495858615959606163606263596061625960565461603854425854595963635962606358615860416138373924
45. gi|21687102|Hs|NP_660304.1|ref Species Homo sapiens 6666516364656766656668676871646971666667616170684160476659696672676968687070666466487462474028
46. gi|85079621|hypotheticalproteinNCU00075[NeurosporacrassaOR74A]|ref|XP_956385.1 6566547064686569656365646765646666636666625665664255436458636567616464646468686565466358634425
47. CMP334CT Species Cyanidioschyzon merolae 7375566674727071707473737272657470757273726372714164487259726872657468736669736974405858666224
48. Esi0159_0032MitochondrialimportinnermembranetranslocaseTIM14homolog(210);mRNA;f:180550-183550 Species Ectocarpus siliculosus 4139483940403940373937383638393741413636394440402542484034393739383837404040403739443735403735

Sequences (FASTA)