ARC Centre of Excellence for Plant Energy Biology

MPIC — PAM16 Interactive MatGAT

Percentage protein sequence similarity and identity scores were generated using MatGAT (Campanella et al., 2003).

Top right = % identity,
Bottom left = % similarity.

1. Point at a cell to temporarily highlight the primary green and secondary light green comparison genes.
2. Click to keep cyan highlighting (click again to remove the highlighting).

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44
1. A8J4S6_CHLRECre|tr		30	17	13	18	18	13	14	15	12	16	14	17	16	12	18	17	5	17	16	18	16	16	16	17	17	16	15	13	17	10	16	18	18	13	12	19	22	16	17	16	15	10	19
2. D8TX81_VOLCAVc|tr	35		29	30	36	36	26	33	27	41	42	29	40	34	31	41	41	10	41	42	40	39	40	39	33	38	42	41	41	36	20	38	37	38	31	31	43	44	42	39	40	36	25	26
3. YJL104WSc	22	48		30	36	40	19	30	35	30	30	25	25	23	24	30	30	11	30	28	28	27	27	26	26	29	28	30	30	23	15	28	25	29	23	26	28	28	26	30	28	26	17	22
4. gi|17553472Ce	29	59	50		45	34	24	27	28	29	29	22	27	28	26	31	30	11	30	31	29	32	31	31	26	30	27	25	27	28	19	28	30	26	22	24	31	31	31	32	29	28	16	21
5. gi|27363461Hs	26	54	52	64		42	29	33	33	39	41	26	35	33	30	39	39	12	39	43	41	39	39	37	34	40	39	39	39	31	18	39	35	38	29	30	40	42	39	38	36	33	19	30
6. gi|85097602Nc	26	55	59	59	63		28	34	31	31	35	25	33	28	27	35	33	9	32	34	34	35	32	34	28	35	32	35	34	31	17	36	37	36	29	29	34	37	34	34	35	31	20	23
7. CMP334CT	25	38	36	40	42	41		28	27	28	31	20	27	24	25	29	29	8	31	31	28	29	28	27	23	29	28	26	28	27	15	27	27	28	19	23	31	28	29	30	27	26	19	20
8. CMK200CT	26	60	51	51	52	56	39		29	33	38	30	30	26	30	41	39	9	40	38	35	40	40	40	30	37	40	33	36	34	20	33	36	33	31	27	32	32	32	35	37	33	29	24
9. Esi0237_0006	25	50	56	52	48	51	41	48		30	31	24	33	26	27	34	32	12	34	35	32	35	33	35	28	33	34	32	31	29	17	34	29	33	26	28	34	34	35	34	32	29	23	21
10. AT5G61880	25	56	47	46	55	51	48	53	43		69	37	49	49	49	68	66	15	70	67	58	64	67	63	51	63	66	63	61	63	32	64	61	65	54	44	60	51	57	70	56	60	27	40
11. AT3G59280	33	54	46	47	60	55	49	58	46	79		40	58	50	61	86	87	14	94	73	66	72	74	72	57	70	73	68	67	64	35	70	60	69	51	47	64	57	62	72	61	65	29	41
12. 29964.m000153|29964.t000004	19	42	41	34	38	40	28	43	41	50	51		32	32	31	38	36	12	40	44	42	43	44	43	40	42	45	38	37	41	28	40	33	37	35	32	36	36	35	39	50	39	29	28
13. 402411	32	54	43	41	55	49	46	50	46	73	77	43		52	43	59	59	11	58	59	54	59	56	59	47	55	60	53	55	55	27	56	48	57	44	38	64	61	65	61	48	53	28	41
14. 76729	30	57	43	48	54	51	40	49	43	63	68	50	73		49	50	50	15	51	54	48	53	54	53	42	51	54	49	44	54	31	51	43	46	49	40	52	51	54	49	46	51	25	34
15. Bra003369	24	51	44	47	49	47	38	49	45	58	69	49	55	64		66	67	16	66	52	44	54	52	52	40	48	50	47	47	53	36	47	45	49	46	36	47	44	46	51	46	53	22	31
16. Bra007441	29	57	46	49	60	52	51	58	48	82	94	49	75	65	70		90	14	91	73	64	74	73	72	58	69	73	68	65	64	34	69	63	69	56	48	64	58	62	70	60	63	28	43
17. Bra014546	33	55	43	47	58	51	47	55	45	77	94	46	76	65	70	95		13	91	68	61	71	71	70	57	64	71	63	63	62	33	66	57	65	49	42	62	55	62	66	56	59	26	40
18. Bra019621	8	15	16	17	15	15	12	14	18	18	18	22	16	20	22	18	17		14	14	13	13	14	13	12	13	14	13	13	16	23	14	13	14	15	15	13	12	13	14	13	16	11	9
19. Carubv10018261m.g	33	56	45	48	57	51	49	58	47	79	98	50	76	68	70	94	97	18		73	66	75	76	74	57	69	74	68	65	64	35	71	60	70	52	47	64	57	62	72	61	64	28	40
20. Cucsa.181450.1	29	52	47	51	62	51	49	53	47	80	85	52	74	71	62	84	80	17	84		80	79	84	78	62	73	82	67	63	67	36	69	61	70	55	49	66	64	65	70	66	63	33	44
21. Cucsa.197950.1	29	54	48	49	58	51	48	52	48	73	80	51	71	69	59	78	77	17	79	89		66	71	66	57	67	71	63	61	57	32	63	53	61	48	40	60	59	59	60	60	54	29	43
22. Eucgr.A00221.1	28	52	46	49	57	53	48	56	47	83	86	53	78	69	64	87	84	18	86	89	80		86	98	61	75	81	67	66	70	36	68	61	71	56	49	64	61	63	70	66	64	33	43
23. Eucgr.H00433.1	28	54	44	49	58	52	47	55	47	84	87	54	78	70	63	86	83	18	86	92	85	96		86	64	78	84	67	66	69	38	69	60	72	54	49	65	61	64	71	68	65	34	43
24. Eucgr.L00545.1	28	52	46	48	57	52	47	55	47	82	86	53	78	69	64	86	84	17	86	88	81	99	95		60	74	82	67	66	70	36	68	60	71	56	49	64	60	63	68	64	63	33	43
25. Glyma02g08820.2	33	44	40	39	51	41	39	45	41	65	71	45	69	60	48	70	67	16	69	73	69	74	74	72		65	73	52	50	52	32	56	59	54	45	36	52	49	51	54	52	51	24	49
26. Glyma06g20480.2	31	52	46	46	58	52	49	53	45	81	85	51	74	66	62	84	80	18	83	85	79	89	91	89	78		84	66	65	64	35	68	64	68	56	49	64	62	65	69	65	63	34	47
27. Glyma16g27940.1	32	54	45	45	60	49	47	54	47	79	85	52	79	70	60	83	81	17	84	88	83	90	91	91	81	93		68	65	68	38	72	63	72	60	52	66	62	66	70	67	64	35	45
28. GRMZM2G048434_T07	31	58	47	46	58	55	45	52	46	78	88	50	76	68	62	85	85	18	87	84	81	84	85	85	68	81	83		77	60	32	92	60	66	55	45	61	58	63	66	58	59	27	39
29. GRMZM2G164475_T01	27	55	46	46	58	54	50	55	44	78	84	48	78	63	60	83	83	17	82	78	77	83	83	84	66	80	79	88		57	31	72	54	65	49	41	65	60	62	68	58	60	26	42
30. GSVIVG01008650001|GSVIVT01008650001	33	54	43	45	54	51	48	50	45	80	79	51	75	70	64	79	78	20	80	84	77	85	85	84	68	83	84	82	78		39	62	59	69	62	50	56	53	57	70	58	71	29	41
31. GSVIVG01013542001|GSVIVT01013542001	16	30	27	28	29	28	24	29	29	39	40	42	35	41	46	40	39	33	40	40	38	42	42	42	37	42	42	39	38	44		35	29	32	36	28	30	28	30	34	35	38	17	21
32. LOC_Os10g33910.1	32	54	45	47	58	54	46	52	46	79	90	51	78	70	62	85	85	18	89	86	81	85	86	86	71	85	86	92	83	84	40		58	67	54	45	62	57	62	70	58	62	27	39
33. PGSC0003DMG400014859|PGSC0003DMT400038494	32	54	42	47	51	50	46	49	42	74	73	45	68	60	54	75	72	17	72	73	68	75	76	74	73	73	74	77	73	76	35	74		64	56	48	55	51	57	60	54	54	25	43
34. PGSC0003DMG400025578|PGSC0003DMT400065725	31	57	47	44	59	56	47	51	49	79	85	50	81	69	62	88	82	18	85	85	81	86	85	87	74	86	88	86	82	84	40	87	78		59	49	64	60	61	78	57	71	27	41
35. PGSC0003DMG400029557|PGSC0003DMT400075993	27	53	43	46	54	53	41	49	46	66	65	49	61	65	64	65	64	20	65	67	62	70	67	70	60	70	70	68	64	71	44	67	65	70		49	49	49	51	56	49	58	29	34
36. PGSC0003DMG400029559|PGSC0003DMT400076009	24	55	48	49	50	48	35	45	45	56	57	47	51	58	57	57	55	20	57	58	54	62	62	62	49	61	62	61	56	62	37	60	60	61	64		42	39	40	47	43	46	29	25
37. Phpat.012G064600.1	33	57	44	46	55	51	47	52	48	78	78	47	84	71	59	77	77	17	77	76	75	76	77	77	67	77	80	77	76	76	37	79	68	79	60	53		79	84	63	56	56	28	44
38. Phpat.018G069100.1	30	60	44	48	60	56	46	55	50	71	72	47	78	70	57	72	70	16	72	76	76	76	76	76	62	73	74	76	71	72	36	74	64	80	62	53	87		85	59	52	53	29	41
39. Phpat.021G010400.1	27	59	44	48	57	52	48	54	50	75	78	46	81	69	58	75	77	17	77	76	77	75	78	76	64	77	80	80	75	77	37	79	69	82	62	55	92	89		62	54	56	30	42
40. Potri.012G108600.1	29	58	48	50	59	56	50	58	47	82	84	50	81	69	66	88	83	18	85	84	78	85	85	85	73	85	85	82	80	86	40	85	75	90	70	59	80	80	81		60	84	27	40
41. Potri.014G151200.1	23	56	49	51	55	56	46	54	47	68	71	60	63	66	63	70	67	18	71	73	71	73	76	73	63	74	73	71	71	71	42	72	64	70	70	61	67	66	65	73		55	33	38
42. Potri.015G106600.1	31	58	46	50	58	56	45	59	47	73	75	52	71	75	68	77	73	20	76	75	72	77	77	76	65	75	77	74	70	81	44	75	66	80	73	61	71	75	73	88	72		25	35
43. Medtr4g116100.1	17	39	32	31	33	34	28	38	39	39	42	52	41	41	40	39	39	20	40	44	41	44	44	45	36	45	45	43	41	41	36	42	35	40	44	41	40	41	42	42	50	41		28
44. Medtr1g098440.1	41	36	35	36	42	35	34	36	32	56	55	38	58	49	43	56	54	13	54	58	56	59	58	59	61	60	58	56	56	57	28	56	60	55	44	39	54	50	52	58	52	50	37

Sequences (FASTA)