ARC Centre of Excellence for Plant Energy Biology

MPIC — OOP,PRD1,OCT1,OCT1-1,OCT1-2 Interactive MatGAT

Percentage protein sequence similarity and identity scores were generated using MatGAT (Campanella et al., 2003).

Top right = % identity,
Bottom left = % similarity.

1. Point at a cell to temporarily highlight the primary green and secondary light green comparison genes.
2. Click to keep cyan highlighting (click again to remove the highlighting).

123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748495051525354555657585960616263646566676869707172737475767778
1. Esi0033_0093 Species Ectocarpus siliculosus 1623232023212331203322202222221821222031202222322225182223232221251723311920232320212321212224313022192331242222212323312421322122241820202323212624232026
2. M1C3Y6_SOLTUSt|tr Species Solanum tuberosum 2512141712161432192316151515131016151332141215311516191413131615171715301417141319131545141514272913121320131314131313331315311313171514161613151713161517
3. AT5G65620 Species Arabidopsis thaliana 4425472480282523252463454441252080848123742489221958157525267069193678225822257215592616622772232325627523242774257775225820222426202224192526232322203623
4. 119899 4128652448272523262357468978272153525324482545241944164524264850192147243323254817422517492549232324384523232652234644244422232623232225222626232223203220
5. 164651 3830414423243723262325272625362526262725253422242224202336372625251623241734362521223818253625232335192325374824372221242621243629201932223634242126232121
6. 28333.m000566|28333.t000012 Species Ricinus communis 4326896640272522262463454441251975767622682474212058167726257170203680226024257316622615652572202325657424242680258381235620222427232223202527242421213523
7. 28658.m000032|28658.t000001 Species Ricinus communis 4027475042472323332228262624231929312923272326222130182724242726221826222124252818252517262328232224222723242727232726222920212326202026212727232121202421
8. 29929.m004709|29929.t000212 Species Ricinus communis 4226474857474623222324252324624424252525245924261924172671692423221725232065712618217117245926242571212524394725802424252520256329222230233534242227212123
9. 30147.m014196|30147.t000467 Species Ricinus communis 4842434741454147205025222221242024252467232322692625402223252323551523691724242340202544222323606424202350232623242121792526692325271825262324222821272028
10. 30484.m000014|30484.t000001 Species Ricinus communis 3431404444414939372228272928211829272922272125212227192520213128211725211921202619232217252227212220212424202428202525222720202221201824212522222219222423
11. 416778 5035464742474247703823232220242125252548242423502325282325262224391525491824252331202633232424494724202552242523252322512524502425271826262525232822251930
12. 439159Sm Species Selaginella moellendorffii 4127767643754949464446525348252068676924622459242156195825246464222462244423256319552719592463242425515925252769256059255721242426232227242627242222223722
13. 85692 3828636547644846444544694343251950495122442342232143204324264848221745233125264619412516462745212325364424222549254342214220222425202126212525232121223120
14. 97030 3829599049604746434844706486272049494922442441222041184325255046211743233022244419392418452445222324354223222748234342234122222523232025212525222321223020
15. 97633 3731558047554343415041646289251845454521402238212038203823234542231940232621224020372420422341212222323923202544223938223821212321211922212424212119212720
16. Bra004078Br Species Brassica rapa 4225464955474481473946484846436325252524238424222025172460602324211525231955612419216116235225242359222423364325632424242419238827222028223231232127222121
17. Bra004244Br Species Brassica rapa 3620383940393659383236363536336920212019175919191820141842431819171320201639432115224413193820202142221919273120451918192117196220181821182523201823191617
18. Bra006067Br Species Brassica rapa 3827857246835050454547827067624936879423862376222156177025257675223173235325256917622716682669232226597025242780257270235621232427212125222727242320223724
19. Bra024401Br Species Brassica rapa 4027887245845152464447837066614938948823792478232057177126277574213273235425267117622816662872232425587025242779257371245720232427222225202727242321223825
20. Bra028579Br Species Brassica rapa 3926867346845151454548847166614837979523872377242157177026267675223173235425257017632815682770232326597025232780257270235721232527212226222728242321223824
21. Bra029169Br Species Brassica rapa 4841434543424348823968464545434737474647222422872625382223252322491622641625242340192739212424585924192247232522242221662326882424271824272525232822272029
22. Carubv10000350m.g|Carubv10000350mCru Species Capsella rubella 3728796745764648424545766866604634898690432270212050166424246968203467225524256316572617622563222124536424212473236563225020212325192023202426222219214022
23. Carubv10019853m.g|Carubv10019853mCru Species Capsella rubella 4124464552484376453744444241388867454646454224231924162456572325211624221953582517225818225025242356202522364023602424242320249026212027233130222127211921
24. Carubv10025914m.g|Carubv10025914mCru Species Capsella rubella 4326956440864647424045746158534437828584427646211955157224246565193674235923256815552517572569222324607222242769247372225418212324202223212426222222193523
25. Carubv10025983m.g|Carubv10025983mCru Species Capsella rubella 4840434543444248834069464443414736474548934345432523392323252322501522651624252341192742212323616125192248232422242222682327932223271825282425222722262029
26. Cre02.g073400.t1.3Cre Species Chlamydomonas reinhardtii 3626363840363942443743404141404032403940473937344522201820192120271519252020201925192116192120252420181925182222191919262152262018211720182119212220251920
27. Cre13.g572900.t2.1Cre Species Chlamydomonas reinhardtii 4425766140764746444246705956514638717373446545754337165725245252212556234022245919472616492559262425465523262755255655247821252424222224202827232424213622
28. Cucsa.251510.1Cs Species Cucumis sativus 3037293235293231503541333435383225313232483230274832301517171917541816381919181740141927151816343618131632161817171615391618381718181518171617171814191817
29. Cucsa.273340.1Cs Species Cucumis sativus 4325876439884746433946726058534538798080427347854434742924266766193577225723246915582618622668222324617322252771257674235417232426222122202425232321203322
30. Cucsa.394790.1Cs Species Cucumis sativus 4324484756474686463846494745428057515252484974464742463246662423221726251863692619236617255826242467212525394725712424252520235928222129223334232126202121
31. Eucgr.B03454.1Cs Species Eucalyptus grandis 4326464754464685483948484745437957505049504774455141443247832526221725252061662519226718245826252566202625384525692324262520256127212228223433242227222022
32. Eucgr.I00594.1Eg Species Eucalyptus grandis 3928786646784949434844776969634736858586458444754442663575474778233370225024246420602618662664222323566525242678237068225221222325232125192528232320233322
33. Eucgr.I00597.1Eg Species Eucalyptus grandis 4227797044804950444447807065604937868687457946774540703377495085203369235123236418602417672664222424566424222578236967225320222425222125202626232220223522
34. Eucgr.K00152.1Eg Species Eucalyptus grandis 3830353943353640644252404042463830393839613837356142356633393941381619501620202154192327202121444923172046192421211918532024512222241623222221202318261823
35. Eucgr.L02517.1Eg Species Eucalyptus grandis 2640423129422828263226353030342823404141274426432726343741292740413336164716153216251615281732151616293416171632173635152517151615141514151616161313162114
36. Glyma01g02480.1Gm Species Glycine max 4625896540924748434047766359554639828383427647884336762990464678793541227224267216612717642673212425707423252776268179235619222426222224202527232322213523
37. Glyma04g13088.1Gm Species Glycine max 4839434642444247843869454543414637464646774343437944424844464643445927431724252339202640222323597725202149232623242220672525652324281925282625232823272029
38. Glyma09g33490.1Gm Species Glycine max 3632675337704140364038615351484031686769377239683635563567394066653554753919205316441921482053181920535718172055206058173918161720191916181820181816193317
39. Glyma11g37410.2Gm Species Glycine max 3930444656454379474044464848457353494649475068424541433545777549464030454541852418216419235224232573192323334123652323232319245526212028213132232024212022
40. Glyma18g01380.1Gm Species Glycine max 4025475055484586493747504746447957505051484774464840453248848348503929484740872618226616235626242682202523374426712425242421256127212130233232252127212122
41. GRMZM2G133919_T01Zm Species Zea mays 4227856642854948434248756460554740808282437449824336763082474775773539854564464817562717612784222425597123262869257169235620232526212425212527242323203623
42. GRMZM2G450659_T01Zm Species Zea mays 3133293238283033513644333335383226323132513230285036286228343336337035294931333229152020171817543818141637162018181616381822401819211421222120181915251720
43. GSVIVG01003850001|GSVIVT01003850001Vv Species Vitis vinifera 3922745837754242393639665653504143717273366640713934632673424168703132743854394272262317582357202022505821232466226059204719192223202022182122202221193022
44. GSVIVG01010319001|GSVIVT01010319001Vv Species Vitis vinifera 4128464758454685464047504845447857504950504874454642463346828248494030474639788148344118266027252767212525384626712625252620276227232030213435252227212123
45. GSVIVG01018572001|GSVIVT01018572001Vv Species Vitis vinifera 3555333437333434573648363535363326343133543734345533324134333435334530345543373532333035171617363917141729181818161616451617421715191718171817171817181919
46. GSVIVG01031425001|GSVIVT01031425001Vv Species Vitis vinifera 4027766944784951444248776763585039838285437646734638673274494978833738774564485275337049342562212224516122222572246463215018212326222226202526242121213322
47. LOC_Os01g67590.1Os Species Oryza sativa 4227474758474780463945494746427555515151484770464742443347807748514030474542737848344179335026242354222523364526582524242420245327211929233433242126212121
48. LOC_Os02g58340.1Os Species Oryza sativa 4327846742854848454248766460564739808282437448824436743082474876773539854564454992317248337747222425597023262869257069245820232426222327212627232323203623
49. LOC_Os06g47210.1Os Species Oryza sativa 4836434442414246783870454342404636454744754243427643424642474743465828437636444644583746524646435524192148222523242120592526592424301925272524223022271928
50. Medtr3g009160.1Mt Species Medicago truncatula 4838434640444146803667444443394537444545744345447543434645454644455827468737434744483845524444457224212345242723252323632426612224271824282324242722252128
51. Medtr3g086000.1Mt Species Medicago truncatula 4025464856454687473646484644427957495049484673454642463345848247494027474840819047324183354977474546202525364325702325252520255928202031223231252126212123
52. Medtr5g030940.1Mt Species Medicago truncatula 3820725233743940373338615147443945666667356141703632612573383764653034763657373969246838276239693638386020202161216564204518202121191819182022202020202920
53. PGSC0003DMG400030613|PGSC0003DMT400078667St Species Solanum tuberosum 4423866339864747423845726157534540798080417348834335732886464675763340874366444883287446347546834143467222252669257473235519212525212223212526222322203322
54. Phpat.016G041000.1Pp Species Physcomitrella patens 4834424446434243684370464647454434454546684641406745434740444547456028416736464341523745484445436763443541222725232222482328482326251926242726252521272127
55. Phpat.018G066900.1Pp Species Physcomitrella patens 4522464152464058413241413938355649414241403858454035452846585840413326464035525644294257304256444241574047396623392424232519233630192028213534242131192023
56. Phpat.019G060600.1Pp Species Physcomitrella patens 4325464867484669464146504747456648524951464863464644473546696850494029484641656847354171354969464646673846477426462626262822254335212035244342272331232125
57. Potri.007G004600.1Pt Species Populus trichocarpa 4126837144865151474449836964605038919192468446804740733281504986883840844769475081337450338550814646496980474249248280225522222526232225202627232221223622
58. Potri.010G054500.1Pt Species Populus trichocarpa 4027474657474590473845494645438158505151494776454741453247848547494028474740798547334185334981474744853947435870502324252520256226211929223535252026202122
59. Potri.014G004600.1Pt Species Populus trichocarpa 4324896439914747423946746158544739818282417548874435752988474777783442914368444784297446347646824344467487414547854796225520222326222223212526232322193322
60. Potri.014G010100.1Pt Species Populus trichocarpa 4423876238884545423945725956524640788080407347844335732886454575763341884266424681287445337345804143467487414645834696225319222324212122202325222221193223
61. Potri.015G129300.1Pt Species Populus trichocarpa 4941444641444248903870444343404537454544814144438244434943464743446326428136454744504046574546447679483741654146464643422427692424262025272524232823272029
62. Vocar20008539m.g|Vocar20008539mVc Species Volvox carteri 4326756141754847444146705957514439717373446545734438882974454567703535754455434672296546326844724243466072414347724574724421232324202124202525222224213522
63. Vocar20013694m.g|Vocar20013694mVc Species Volvox carteri 4025394336403841473645434041384032414041463939404765393139404041403826414634373941333839323939414547393640463742413940394741271819231721192221222421241821
64. AT5G51540At Species Arabidopsis thaliana 4841434542444048833769464443414836474647944245429746464743485045466227437937464944503948554648447676483643684047484743428244482323271825282424222822261930
65. AT1G67690At Species Arabidopsis thaliana 4125454856464482463944484645419468484847474592454739453146807947483928464739738048324078344975474645784047445667508046454444394727222029243332232126222022
66. YCL057WSc Species Saccharomyces cerevisiae 4125484746484752453847484745435239494949464549464638453047515246483727474540475247354151344850484745523844474855495146444445404650202133233635312227202025
67. gi|32565901Ce Species Caenorhabditis elegans 4131404540423945483747444243414333444444484241394742413240474443434126404933424442353744374244424846443342453843444541384641414642451720232020192519241726
68. gi|71999758Ce Species Caenorhabditis elegans 3726454335444042413241444139364237434444404042433933452843424341423226444035394145273941334341443942433744374041424344434044363941423818182019181918181919
69. gi|66801567Dd Species Dictyostelium discoideum 3928444851444651474147494947455137504949474748444741433344525149474027444637485045353952354552464745523643474656485243424643414651564237233735272126202023
70. gi|268637658Dd Species Dictyostelium discoideum 4328424643434345493750464443404636444545504144415038433045474742423926435034434645333945354545444949463643454045444642414943405045474642452323212420221825
71. gi|4507491Hs Species Homo sapiens 4129454653454758474146494844425542515050484852444739453246565748493929454937535645344058334857454746563845465365495844424743404755554239584561302431222223
72. gi|14149738|NP_065777Hs|ref Species Homo sapiens 4228474853464761484147494646425741485048484655454839463145595846473628464839545747334058354759454546573846455463486046444745414857564239584876282332212124
73. gi|85107353Nc Species Neurospora crassa 4027454540474146443944454343414637464746424344434339443144464744443627444337424644323846314645444345473844434348464644434444414246534240474649492224222024
74. gi|85111610Nc Species Neurospora crassa 4527444238454243473649404140373936424242454041444539452945424141423625454634384243304042314142444847413744424242424144434745434539444438404641424223241936
75. CMS446CTCm Species Cyanidioschyzon merolae 4020383638383743373037353434324243353735353343373731392439424234362923393730394338243842273642373537444039354945354238383739353742413335413745463938191921
76. CMS132CTCm Species Cyanidioschyzon merolae 3932384047383940454244414343424332414142474140364540373537424244434530404637434238423442374042374743433237473645414037364638384542404434394243424240311923
77. Esi0023_0135Es Species Ectocarpus siliculosus 3528495043504240374437535250494030545455375936493736483349413953533434503954393951314440385041513738404048413541543949473748333739383436403842393836323620
78. YKL134COct1 Species Saccharomyces cerevisiae 4628464238454144493750444140394134444544484044454939432946444443423626465035414446314043354344454751443945444445444346454945424942454541404843434355384239

Sequences (FASTA)