ARC Centre of Excellence for Plant Energy Biology

MPIC — MDM1 Interactive MatGAT

Percentage protein sequence similarity and identity scores were generated using MatGAT (Campanella et al., 2003).

Top right = % identity,
Bottom left = % similarity.

1. Point at a cell to temporarily highlight the primary green and secondary light green comparison genes.
2. Click to keep cyan highlighting (click again to remove the highlighting).

123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839
1. YML104C Species Saccharomyces cerevisiae 2218141718181618181918181818191818171817181917171718161917181717181917171717
2. gi|164426626|ref|XP_957576.2Nc Species Neurospora crassa 4519141918191819181919171920201918191818181919182119162018181919191920181918
3. gi|17864088|NP_055947.1|ref|sortingnexin-13[Homosapiens] 3837162022212120211819231919192021202322231919201920172022212021212020212121
4. gi|17506801|NP_492758.1|ProteinSNX-27Ce|ref Species Caenorhabditis elegans 2724321415161413151414161414151515151615161515151513171415151416141415151314
5. AT1G15240. Species Arabidopsis thaliana 3938432732353256335057323333333331893132327783315056244431325331325332335554
6. AT2G15900 Species Arabidopsis thaliana 3835452954385932553132593536343649328188823132483030413247533153553258573131
7. 413327|Smo:413327 3536432956613935393336423940384039363737383336363235313436383338393439403533
8. 29851.m002502|Rco:29851.m002502 3836442854746033633132663737363750325457593134533033443149583356583371703333
9. 30146.m003594|Rco:30146.m003594 3938412670535555335669333434343534573233325458325561254732336032335933347070
10. Csa:Cucsa.220190 4037412754716077533133633837353751335355563134533032423249593256603261613334
11. Csa:Cucsa.359160.1 4238392567515152715157313433323330513031314851305257224629305829305831315959
12. Vvi:GSVIVT01017080001 3938402571525454815472343535343432583233335457325663234931346332346333336565
13. Vvi:GSVIVT01031845001 3935442954766279527551523737363652325458593134533032443249593158603164643232
14. Ppa:Pp1s67_32V6.1 Species Physcomitrella patens 4040382452545757545755555653505136343435363134343233273235373335363237373534
15. Ppa:Pp1s7_51V6.1 Species Physcomitrella patens 3938382654555858565955565770626336343435363233353335273435373536363437373434
16. Ppa:Pp1s48_155V6.1 Species Physcomitrella patens 4039372753535658545653555667776834333334353132343135263433353333353334353434
17. Ppa:Pp1s68_34V6.1 Species Physcomitrella patens 3939392753555758565753555668788035343435363233343234273535353432343435373335
18. Zma:GRMZM2G026442_T01 3936422854675970556953537157565556324648503232452932343177493148503049493232
19. Cru:Carubv10008179m 4037422695555655715667725552535353553133327783315057234531325431325433335655
20. Cru:Carubv10012892m 3936422853896072537050537453545254655488752931462930383044503150513154533030
21. Cru:Carubv10012885m 3837442853926175547251547555555555665593823132492932393246533253543258573131
22. Bra:Bra015246 Species Brassica rapa 3837443055916175537350547656565455685588903133492932403147543154553159583131
23. Bra:Bra026152 Species Brassica rapa 3737412786525553705364705349525252538651525380284753254230315130315131315352
24. Bra:Bra026776 Species Brassica rapa 4038432691545856725568735453535352559055565589315058234432335432335433325655
25. Mtr:Medtr4g087210 4139382651645468526750536655575657625164666648502932353044693058703053533131
26. Mtr:Medtr4g012920 3841362664474949684868684653545253486446484762644856214329307128307132305857
27. Egr:Eucgr.F03028 4139402572515354775373785254555453557351535171745270234831326231326232346665
28. Egr:Eucgr.G01512 3129363340544756385337375640414041493952535338394634382233402239402243422323
29. Osa:LOC_Os05g50660 4040402662515352675367655153555455516250505061645262673530314731314833324848
30. Osa:LOC_Os11g06040 4038432753635868546753536655575656855462646451536349544753483047483047473130
31. Gma:Glyma02g15445 Species Glycine max 3936422855715874537452547556585656685569727252557748535452653265933257583232
32. Gma:Glyma08g21950 Species Glycine max 4039392669515353745274765154565556516951515167695081753768525130339331326563
33. Gma:Glyma20g01140 Species Glycine max 3935422853706172517350527554565553665370717250537046535350647950653056553031
34. Gma:Glyma07g33040 Species Glycine max 4037422856715974537452547455575657695570727252557748535451669652793358573332
35. Gma:Glyma07g00690 Species Glycine max 4139402669515354745374765253555455516950525167695081753768535296495232326463
36. Ptr:Potri.009G108300 Species Populus trichocarpa 4136412954735984557653557657585557685571747352556849545452667451727352843333
37. Ptr:Potri.004G146600 Species Populus trichocarpa 3736432754726082547652557657585758695470737350546850565453677352707352913333
38. Ptr:Potri.003G053200 Species Populus trichocarpa 4139402570515353795274785155575556536949515169715471783867525379495279545486
39. Ptr:Potri.001G183100synonym:POPTR_0001s18360 Species Populus trichocarpa 4239412569525254805373775355555658537049525168715373783868525380515279555592

Sequences (FASTA)